Identification of mycobacterium tuberculosis by genexpert® MTB/RIF in pulmonary and extrapulmonary samples in adults from the Sergio E. Bernales National Hospital, Lima - Peru, 2022

Abstract

Tuberculosis is an infectious disease caused by Mycobacterium tuberculosis (the Koch bacillus). Microbiological culture remains the gold standard for diagnosing tuberculosis in all its forms; however, its disadvantage lies in the slow growth of the bacillus in culture media. The aim of this research was to determine the diagnostic validity of GeneXpert® MTB/RIF for identifying Mycobacterium tuberculosis in pulmonary and extrapulmonary samples from adults. A non-experimental, descriptive comparative study with a quantitative approach was conducted on 644 pulmonary and extrapulmonary samples. The study found a frequency of Mycobacterium tuberculosis of 17.7% in bacilloscopy, 24.8% in culture, and 27.8% with GeneXpert MTB/RIF. Sensitivity, specificity, Positive Predictive Value, and Negative Predictive Value were 95.6%, 94.6%, 85.4%, and 98.4%, respectively, when culture was used as the reference, and 97.4%, 87.2%, 62%, and 99.4%, respectively, when bacilloscopy was the reference. Conclusion: The GeneXpert MTB/RIF method showed high diagnostic validity and is a reliable technique for identifying Mycobacterium tuberculosis.

La tuberculosis es una enfermedad infecto contagiosa cuyo agente causal es el Mycobacterium tuberculosis o Bacilo de Koch. El cultivo microbiológico continúa siendo considerado el estándar de oro para el diagnóstico de tuberculosis en todas sus formas; sin embargo, su desventaja se debe al crecimiento lento del bacilo en los medios de cultivo. El objetivo de esta investigación es determinar la validez diagnóstica de GeneXpert® MTB/RIF para la identificación del Mycobacterium tuberculosis en muestras pulmonares y extrapulmonares en adultos. Para ello, se realizó un estudio no experimental, descriptivo comparativo, de enfoque cuantitativo y de tipo aplicada a una población de 644 muestras pulmonares y extrapulmonares. La investigación encontró una frecuencia de Mycobacterium tuberculosis del 17.7% en la baciloscopia, del 24.8% en el cultivo y del 27.8% cuando se utilizó el GeneXpert MTB/RIF. Así mismo, se halló una sensibilidad, especificidad, Valor Predictivo Positivo y Valor Predictivo Negativo del 95.6%, 94.6%, 85.4% y 98.4%; respectivamente, cuando se tomó como referencia el cultivo y del 97.4%, 87.2%, 62% y 99.4%; respectivamente, cuando se tomó como referencia la baciloscopia. Finalmente, se concluyó que la metodología GeneXpert MTB/RIF presenta una alta validez diagnóstica, siendo una técnica confiable para la identificación del Mycobacterium tuberculosis.